截至2013年末,大丰区共有各类卫生机构337个,其中医院、卫生院32个。各类卫生机构拥有床位2724张,共有卫生技术人员3169人,其中执业(助理)医师1685人,注册护士913人。乡镇卫生院16个,村卫生室218个,有注册乡村医生696人。新型农村合作医疗覆盖率达100%。居民平均期望寿命78.9岁,婴儿死亡率2.15‰,出生缺陷发生率2.79‰,孕产妇死亡率为零。2013年,率先在全省开展乡村医生签约服务工作,成为江苏省唯一的乡村医生签约服务国家重点联系县(市),在全省率先开通使用居民健康卡。
截至2014年末,大丰区共有公立医疗卫生机构22个,民营医疗机构15个。全系统共有职工2049人(不含民营医院,下同),其中卫生技术人员1742人,每千人拥有医生数2.31人,实际开放床位3216张。城乡基层卫生服务网络更加健全,镇卫生院16个,村卫生室215个,注册乡村医生653人。新型农村合作医疗覆盖率达100%。全市人民群众健康水平达到苏北地区先进水平。居民平均期望寿命79.6岁,婴儿死亡率3.72‰,孕产妇死亡率为零。2019年8月,入选为紧密型县域医共体建设试点县。